生物科学门户网站
BIO1000.COM

SARSCoV2可能使用的蛋白质序列感染细胞

在COVID-19大流行的早期,人们已经确定SARS-CoV-2通过与人类蛋白ACE2结合来感染细胞,后者在调节血压中起着作用。但是人肺细胞中几乎不存在ACE2,那么肺如何成为COVID-19中受影响最大的器官之一?这给研究人员一个暗示,即ACE2可能不仅是血压调节剂,而且可能不是SARS-CoV-2感染机制的唯一参与者。

EMBL的Gibson团队与LucíaChemes合作来自布宜诺斯艾利斯国立圣马丁大学的学生以及来自默克(Merck KGaA)达姆施塔特(Dermstadt)和都柏林大学的合作伙伴分析了ACE2和参与SARS-CoV-2感染的其他人类蛋白质的序列,例如一类称为整合素的蛋白质。他们专注于称为短线性基序(SLiM)的短氨基酸序列,它们参与细胞内部和外部之间的信息传递。团队和合作者已经开发了20年,这是最大的精选SLiMs数据库-真核线性基元(ELM)资源,可以快速识别和比较SLiM。

他们发现ACE2和几种整联蛋白含有SLiM,它们可能分别与胞吞作用和自噬有关-细胞摄取和处置物质的过程。该结果表明ACE2和整联蛋白在细胞生理学中的以前未知的作用。“如果SARS-CoV-2靶向内吞和自噬相关蛋白,则意味着这些过程可能在感染过程中被病毒劫持,”吉布森研究小组的博士后,第一位作者巴林特·梅萨罗斯说。Ylva Ivarsson

通过实验验证了一些发现和她在瑞典乌普萨拉大学的小组。他们证实了预测的蛋白质相互作用,并验证了这些相互作用受天然存在的含磷离子添加的调节。“ Ylva Ivarsson是我们认识的检验这些预测的最佳人选。我们很高兴她同意加入这个项目。” EMBL团队负责人Toby Gibson说。Ylva Ivarsson同样热情。她补充说:“将我们的工作转向与SARS-CoV-2相关的研究有助于我们在大流行期间将精神保持在实验室中。”

COVID-19的潜在药物

这些发现可能会为COVID-19带来新的治疗方法。“ SLiM可以'切换'以打开或关闭病毒进入信号。这意味着如果我们能够找到一种使用药物逆转这些开关的方法,那么这可能会阻止冠状病毒进入细胞。”资深作者LucíaChemes说。

该团队与来自默克(Merck KGaA)达姆施塔特(Darmstadt)的合作者一起,收集了干扰内吞和自噬的现有药物清单。该清单包括一些令人惊讶的候选药物,例如抗精神病药氯丙嗪。“如果临床试验证明其中某些药物可对抗COVID-19起作用,那可能会改变游戏规则,”吉布森研究小组的生物信息学科学家,这项研究的资深作者曼吉特·库马尔说。

郑重声明:本文版权归原作者所有,转载文章仅为传播更多信息之目的,如作者信息标记有误,请第一时间联系我们修改或删除,多谢。