研究人员创建了人类结肠内免疫细胞和肠道细菌的第一个详细细胞图谱。来自惠康桑格研究所和合作者的研究揭示了不同的免疫ni，显示了整个结肠中细菌微生物组和免疫细胞的变化。作为“人类细胞图谱”计划的一部分，该计划可绘制每种人类细胞的图谱，这些结果将使人们能够对影响结肠特定区域的疾病(例如溃疡性结肠炎和结直肠癌)进行新的研究。

今天发表在《自然免疫学》上的这项研究揭示了微生物组与免疫细胞之间的相互作用。这些结果构成了重要的资源，将有助于科学家了解健康的免疫系统如何耐受这些微生物细胞。

肠道微生物组是一个由数百万个微生物组成的复杂生态系统，这些细菌被认为在消化，调节免疫系统和预防疾病中起着重要作用。它们对人类健康至关重要，肠道微生物组的失衡会导致自身免疫性疾病，例如炎症性肠病和哮喘。

肠道还具有丰富的免疫细胞群落，有助于修复组织并防御感染。但是，关于微生物组如何与肠道常驻免疫细胞相互作用，哪些免疫细胞与细菌在不同位置共存以及为何不同疾病影响肠道不同区域的信息很少。

为了阐明这一点，研究人员研究了来自器官捐献者*的健康结肠的三个不同部分，同时分析了每个区域的免疫细胞和细菌微生物组。通过对41,000个单个免疫细胞的活性基因进行测序，他们能够鉴定在每个位置的不同免疫细胞群体中开启的细胞类型特异性基因。他们还鉴定了存在于同一结肠区域的细菌，以揭示免疫系统与细菌之间的相互作用。

肠道微生物组在健康和疾病中起着重要作用，了解其如何与免疫系统相互作用至关重要。我们独特的方法使我们能够在健康的人类结肠中创建免疫细胞及其附近细菌的第一张深度图，并令人惊讶地发现，整个结肠中存在独特的免疫immune，不同区域的细胞活化状态不同。”惠康桑格研究所的Kylie James博士评论道。

这项研究表明，不仅结肠不同部位的免疫细胞之间存在差异，而且微生物组也发生了微妙的变化，结肠下方的细菌种类更多。

“我们由与人类细胞一样多的细菌组成，人类与其微生物组之间存在共生关系。我们知道这与健康的许多方面有关，肠道细菌的失衡与免疫性疾病(从炎症性肠病到哮喘)有关。通过揭示结肠中特定位置的微生物组的多样性以及与免疫细胞的相互作用，我们可以开始了解其背后的生物学原理，并为今后针对特定部位的肠道细菌的研究提供参考。”惠康桑格研究所的特雷弗·劳利博士评论道。

先前对小鼠的研究表明，淋巴结中的免疫细胞可以靶向特定的目标，例如免疫卫星。这项研究首次显示，抑制免疫反应的调节性免疫细胞从淋巴结转移到结肠。这可能是肠道耐受甚至欢迎微生物组的一种方式。

“这项研究是全球人类细胞图集计划的一部分，该计划旨在绘制人体中每种细胞的图谱。它使人们对健康的结肠组织中的免疫细胞与微生物组之间的关系有了新的认识，并且通过使我们能够专注于特定区域的细胞，它将成为正在进行的影响结肠特定区域的疾病研究的重要参考。 ”惠康大学桑格研究所所长，人类细胞图谱组织委员会联合主席Sarah Teichmann博士对此发表了评论。