使用手持式DNA测序装置，他们可以在收集样品后48小时内确定农民田间小麦锈菌的精确菌株。这为全球研究人员提供了发现和控制新出现的流行病所需的重要时间。

自农业开始以来，小麦锈病几乎威胁到小麦生产，全球所有主要小麦种植区的收成仍受到威胁。最好的防御是种植抗感染的小麦品种，但随着时间的推移，新的锈病菌株会发展，导致新的流行病。保持领先生锈的最佳方法是快速识别和跟踪田间疾病。

BMC生物学论文“MARPLE，一种针对复杂真菌病原体的即时，应变水平疾病诊断和监测工具”，展示了研究伙伴关系如何将诊断速度从高端实验室的数月降低到距埃塞俄比亚地区仅2天。埃塞俄比亚CIMMYT的锈病病理学家，合着者Dave Hodson博士说：“了解你所拥有的哪种菌株，是可以纳入早期预警系统的关键信息，从而更有效地控制农民田间的疾病暴发。”

“挑战是跟踪小麦锈病并不像你想象的那么简单。有许多不同的菌株，都具有独特的特性，如果没有冗长的实验室测试，就不能分开。因此，确定哪些是威胁可能需要很多很多个月，可能是感染蔓延的时间。“John Innes中心的主要作者兼集团负责人Diane Saunders博士说。

研究人员创建的新MARPLE(移动和实时PLant disEase)诊断平台针对可以在Oxford Nanopore的便携式MinION测序平台上测序的部分锈病遗传密码。“这有助于我们区分紧张，迅速认识到我们之前见过的人，或发现可能成为新威胁的新人。”第一作者约翰英纳斯中心的Guru Radhakrishnan博士说。

“开始作为概念证据的东西现在已经在现场使用，”桑德斯博士说，“这一发展将有助于加强对作物病害压力的监测和更有针对性的控制。”

小麦农民面临的部分挑战是，他们经常与猫和老鼠患病。了解当地哪些小麦锈病菌株可以提供哪些小麦品种最安全的建议。

“最后，通过这个项目，我们可以将最新技术带到现场，不仅可以告知研究人员，还可以告知农民，”EIAR农业生物技术研究理事会主任Tadessa Daba说。