扁桃体手术的后遗症主要包括以下几个方面：

1. 术后出血：由于扁桃体手术创伤部位在咽部，如果在术后伤口护理不当，可能会导致局部出血，严重的情况下可能需要再次进行手术止血。因此术后应注意保护伤口，避免剧烈运动和食用过于坚硬的食物等。

2. 创面感染：术后容易出现创面感染的问题，可能伴随发热症状。需要在医生指导下使用抗感染药物来治疗。为了避免感染，术后应保持口腔清洁，定期漱口。

3. 呼吸问题：由于扁桃体位置特殊，手术可能会影响到呼吸通道，导致呼吸不畅或呼吸困难等问题。在术后恢复期间，需要注意呼吸状况，如有异常应及时就医。

4. 瘢痕形成：虽然扁桃体手术不会涉及深层组织，但如果在术后出现瘢痕增生等问题，可能会对咽喉部位的肌肉产生影响，出现吞咽障碍等情况。可以通过激光手术等方式去除瘢痕。

5. 免疫力下降：扁桃体是人体免疫系统的一部分，切除后可能会对免疫系统产生一定影响，导致免疫力下降。因此术后需要注意休息和营养补充，以促进身体恢复。

除了上述后遗症外，扁桃体手术还可能出现其他并发症和风险，如局部水肿、过敏反应等。因此在进行手术前，患者和医生应充分了解手术风险并制定相应的手术方案。以上信息仅供参考，如有疑虑或症状持续不缓解，建议及时就医咨询专业医生的意见。